在好氧性條件下，由于好氧性菌的作用，將去除畜糞中的有機物在分解過程中產生的有害物質，同時蒸發畜糞中的水分，使之變成易于處理的優質有機肥。
重要的是改善畜糞中的通氣性，使通氣均勻，這樣好氧性菌會迅速增殖，反復進行發酵活動。
再則，需要空氣的理由是因為伴隨發酵所產生的熱量蒸發水分，使之成為低水分的易于處理的堆肥。
同時由于發酵過程中產生的發酵熱，能殺死病原菌及雜草種子等。
